Job Openings, Master-, Bachelor- and HiWi positions

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Bachelor- und Masterarbeiten (in German)

Wir vergeben Bachelor- und Masterprojekte für Studierende der Fachrichtungen Physik, Materialphysik, Integrated Life Sciences, Medizintechnik, Materialwissenschaften, Molekulare Medizin, Biologie, Mathematik etc.
Je nach Ihren Neigungen und Qualifikationen (Programmierkenntnisse, Elektronik-Kenntnisse etc) bieten wir eine große Anzahl von zellbiologischen und biophysikalischen Fragestellungen im Rahmen von einer Bachelorarbeit oder Masterarbeit an, die jeweils eng an laufende Forschungsprojekte angebunden sind und deshalb ständig neu hinzukommen oder adaptiert werden.  Dazu zählen beispielswiese die  Charakterisierung der Metastasierung von Tumorzellen, Proteinen des fokalen Adhäsionskomplexes, und Proteinen des Zellskeletts mit neuen biophysikalischen Methoden, inklusive Mitarbeit bei der Methodenentwicklung,  wie magnetic tweezer, 3-D traction microscopy, Migrationsanalyse, microrheology, cell stretcher usw. ILS-Studenten, die sich für ein biophysikalisches Thema interessieren, seinen außerdem Projekte in der Kristallographie  (Link) empfohlen. Oder nehmem Sie Kontakt auf mit Prof. Vahid Sandoghdar auf (MPI for the science of light).
 
Untersuchung des kollektivenMigrationsverhaltensvon Tumorzellen
Fragestellung: Wie koordinieren Tumorzellen ihre Bewegung bei der Invasion in benachbartes Gewebe? Welche Unterschiede gibt es zwischen verschiedenen Tumorzell-Linien?
Methoden: Zellkultur, Fluoreszenzmikroskopie, Konfokalmikroskopie, Bildverarbeitung in MatLab, Korrelationsanalyse, Modellierung
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Migration von Tumorzellen durch mikrostrukturierte 3-D Kanäle
Fragestellung: Wie gelingt es Tumorzellen, durch kleine Poren und Spalten zu migrieren? 
Methoden: Zellkultur, life cell imaging, staining, Fluoreszenzmikroskopie, Konfokalmikroskopie, Bildverarbeitung in MatLab, Soft lithography
dazu gibt es auch eine kurze Erläuterung auf englisch:
Cell Migration in Microfluidic Devices --- Lab-on-a-chip
During metastasis formation, cancer cells migrate through a dense extracellular matrix. How exactly they do that is currently not well understood. To study this process of cell migration in a 3-dimensional environment,  we use soft lithography technology to build a 3-D structure containing pores and channels similar to those of living tissue.  You will learn cell culture and soft lithography techniques, and will be working with modern microscopes and image processing methods.  Basic programming skills are welcome but not required.
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3-D Kraftmessung
Fragestellung: Wie kontraktil sind Zellen in einer 3-D Umgebung?
Methoden: Zellkultur, life cell imaging, staining, Konfokalmikroskopie, Bildverarbeitung in MatLab, Finite-Elemente-Berechnungen, continuum mechanics
 
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Thema: Myofibrillären Myopathien.

Dabei handelt es sich um eine Gruppe von sporadischen und erblichen Krankheiten der Skelett -und Herzmuskulatur, die zu schweren körperlichen Behinderungen und vorzeitigem Tod führen. Die Arbeiten werden in enger Kollaboration mit klinischen Partnern (Uni-Klinik, Erlangen) durchgeführt.

Notwendige Qualifikation: Bachelor in ILS, Biologie oder Biochemie.

Wünschenswerte Qualifikation: Grundkenntnisse in MATLAB, Konfokalmikroskopie und Zellkultur. Kenntnisse in computergestützter Bildgebung und Bildauswertung sind vorteilhaft, aber nicht Bedingung.

Bemerkungen: Die Stelle soll zum Master (M.Sc.) der Bewerberin/des Bewerbers führen. Aufgabe des Masterstudenten(in) ist es, mechanische Messungen an skeletalen Myoblasten und Myotuben von zwei der häufigsten humanpathogenen Mutationen (R155C VCP und W2710X filamin C) mittels Traktionsmikroskopie, Magnetbead-Mikrorheologie und einem Zellstretcher in Kombination mit Konfokalmikroskopie mit hoher zeitlicher und räumlicher Auflösung durchzuführen.

Für Auskünfte kontaktieren Sie bitte Prof. Wolfgang Goldmann, PhD, Biophysics Group der FAU, Center for Medical Physics und Technology, Henkestr 91, 91052 Erlangen. Phone: (+49) (0)9131-85-25605 fax: (+49) (0)9131-85-25601 email: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.


Dilated cardiomyopathy caused by mutations in A-type lamins.

Dilated cardiomyopathy is one of the leading causes of heart failure in Europe. Despite of the conventional medical care, there is no definitive and satisfactory treatment for the progressive cardiac dilatation and loss of contractility in LMNA cardiomyopathy short of heart transplantation. LMNA gene encodes nuclear A-type lamins, which are the main constituents of the nuclear lamina. To explain how mutations in proteins of the nuclear envelope can cause a disease of the heart, it has been proposed that nuclear envelope abnormalities bring about cellular fragility and a decrease in the mechanical resistance to stress, which could partially explain the cardiac muscle disease, considering that the heart muscle is constantly subjected to mechanical force.

In preliminary work, we showed that there is an abnormal activation of stress-activated ERK1/2 signaling in hearts that carry LMNA mutations. Administration of drugs inhibiting ERK1/2 signaling improves cardiac ejection fraction in mice and blunts further increase in left ventricular dilatation. These studies clearly show that the abnormal ERK1/2 activation is involved in the pathophysiology of LMNA dilated cardiomyopathy.

It is therefore important to further our knowledge on the pathophysiology of cardiomyopathies and to determine the influence of external/internal stress in order to unveil molecular/cellular mechanisms to target future therapeutic approaches. 

Required qualifications: Bachelor in ILS, biology or biochemistry.

Desirable qualifications:  Basic knowledge of MATLAB, confocal microscopy and cell culture. Knowledge in computer-aided imaging and image analysis are advantageous, but not essential. 

 
 Name email   Beginn  Thema  Betreuer
David Böhringer This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. März 2015  Spheroide: Traktionsmessungen  Christoph Mark
Annemarie Pfnür

aThis email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

Feb 2015 Spheroide: Vergleich unterschiedlicher Tumor-Zell-Linien (wie in Janina's 2D-Studie) Christoph und Ingo 
         
Christian Heidorn  This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.  April 2015  high speed camera system for life cell imaging Sebastian, Janina
Monika Spermann This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. mitte April 2015 Zusammenhang zwischen Zellsteifheit und 3-D Migration bei Tumorzellen Janina
Sabrine Munz undCorinna Munz cThis email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.   Ende Feb 2015 Einfluss von Kollagendichte, Steifheit und adhäsive Funktionalisierung auf das Invasionverhalten bei verschiedenen Zellarten Einfluss der Zelldichte  Christoph und Ingo 
         
Sarah Hoepffner

sThis email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

März 2015 Mechanismen der Tumorzell-Invasion (Einzelzellen, Organoid, Einfluss der Matrix, Einfluss von Zelleigenschaften wie Adhäsivität, Kontraktilität etc.) Christoph, Ingo, Ben
Elena Schindelek

 This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

2. März 2015 dynamisches Zell-Tracking (Bayes Fingerprinting): Einfluss der Tiefe, Einfluss der Zelldichte, Einfluss der Matrix (Porosität, Stiffness etc)  Ben etc
Moritz Brehm

This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

20. März Python for cell tracking in a 3D collagen matrix: correlation between cell migration and local geometry Richard

Jonas Auernheimer  

  

 

März    März2015

 

Spheroide und Vinkulin2D Lamellipodium bei VinkulinChorion Allantoic Membrane Assay mit vinkulin-defizienten Zellen 

Ingo    

 

Delf Kah This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. 2. März Effekt unterschiedlicher Polymerisations-Bedingungen auf die Kollagen-Struktur Chris, Claus
Alexander Winterl

This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

 2. März Random Walks und Probabilistic Programming  Chris, Claus
         
         
Nina Bauer, Master  This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. MA, 13.10.2015 Bildverarbeitung, Programmierung, Mustererkennung Chris oder Richard

Ozlem Özel

Bachelor

This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. BA, 14. Oct 2015 Vergleich der 3-D Einzelzell-Migration verschiedener Tumorarten Breff, Ben

Thorsten Götz

tThis email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. MA, Oct 2015 T-cell - tumor interactions in 3D Christoph Mark

Beate Hartmannsberger

This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. MA, 15 Oct 2015 Microconstrictions; carbon black Effekte Janina
Samuel Winkler sThis email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. MA, Ende Oct Viskosität und viskoelastische Eigenschaften von biologischen Proben Ben
Jakob Peschel jThis email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. MA, Ende Oct Huddle-Bildung bei Kaiserpinguinen Richard
Andrea Thomaß,  aThis email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. MA, Nov 2015 Tumor-Migration tba
Thomas Hirschmann tThis email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. MA, Mar 2016 Powerlaw-Rheology Claus
Julian Übelacker This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. MA, Mar 2016 Inference of particle interactions Claus
Katharina Tkotz  This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. BA, Mar 2016 Grid-based Monte-Carlo sim. Claus
Julia Kraxner This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. MA, März 2016 3D Muskelstretcher Ingo
Claire Amadio This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. BA, März-Juli 2016 3-D Muskelgewebe Ben

Alexander Wischnewski

This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

BA, 1.5.16

Tumor-Invasion

Ingo

Fumina Yoshimoto

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Visiting Student

Mai-Juli 2016

Myofibrilläre Myopathie  Marina/Wolfgang

 

Richard Holfeld

 This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. BA, Okt 2016 - Jan 2017  3-D Muskelgewebe  
 Mona Seifert

 This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

 Mitte Oct 2016

Bildverarbeitung, Programmierung, Mustererkennung

z.B. 3-D Muskelgewebe

entweder Janina oder Ben oder Ingo oder Richard
Thomas Halbauer 

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Oct 2016

Projektpraktikum Physik in der Medizin

 
Michelle Küppers This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. Oct 2016 Projektpraktikum Physik in der Medizin  
Sandra Wiedenmann This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. Master ILS, ab 17. Oct 2016 Herzmusdelgewebe Ingo/Ben
 Katrin Zerbe  This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

Master Medizintechnik

15. März 2017

Mechanik und Adhäsivität von Keratinozyten bei Keratin Mutationen  Marina

Christopher Dürrbeck

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Master Physik

7. Feb 2017

 magnetic twisting / tweezing  Ben

Christina Hillig

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 Master ILS

1. Sept 2017

 NK Zellen  Christoph

Anja Amthor

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Bachelor ILS

10.4.2017

Mikropartikel Ben

Lea Pflüger

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Master Medizintechnik 8.5.2017

Mechanische Veränderungen in Nervenzellen bei Aktivierung Ben

Marco Fleischer

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Bachelor Medizintechnik 02.05.2017

Design einer Inkubationskammer für Mikroskope zur Langzeitmessung von Zellmigration unter Temperaturkontrolle Ben

Lucie Plankesteiner

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Bachelor Physik 24.4.2017

Optimierung der Kollageneigenschaften und Geometrie zur Bildung von Skelettmuskel-Mikrogeweben Ben

Luise Böttcher

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Bachelor ILS

24.4.2017

Pinguine 'Richard

Lucas Heublein

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Bachelor ILS

18.4.2017

 Zelltracking Ben, Claus, Christoph, Alex

Michael Hlavatsch

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ILS Bachelor

18.4.2017

 Tränen  Ben